DYP'nin Genel Başkan Mehmet Ağar'ın uyarısı ile cumhurbaşkanlığı seçimleri ilk turunda meclise gelmeyerek, siyasi sapma yaptığını belirten Boğa, bundan sonraki siyasi hayatını bağımsız olarak sürdüreceğini açıkladı.

Cumhurbaşkanı seçimleri esnasında CHP ile aynı yönde tavır alan DYP'de bir istifa da Fethiye'den geldi. 28 Mart 2004 yerel seçimlerinde DYP'den belediye meclis üyesi seçilen Mehmet Boğa, partisinden istifa ettiğini söyledi.

Yazılı bir açıklama yapan Boğa, bu kararı almasında DYP Genel Başkanı Mehmet Ağar'ın cumhurbaşkanlığı seçimlerindeki tavırlarının etkili olduğunu söyledi. DYP'nin 'Yeter Söz Milletindir' misyonuyla 1946 yılından bu yana milli ruhu ve duruşu temsil ettiğine inandığını kaydeden Mehmet Boğa, "Biz 1946'dan beri bu kriz tezgahlarından çok çekmiş bir misyonun temsilcileri olarak; CHP'nin dümen suyuna girerek, millet iradesinin yegane ve tek temsil edildiği yüce meclisi boykot edemeyiz ve etmemeliyiz" açıklamasında bulundu.